Томская
Учреждена 22 апреля 1834 года
Томская и Енисейская
Кафедра в Томске
| Агапит (Вознесенский) епископ, рукоположен | с 12.08.1834 по 10.06.1841 | на покое, член Московской синодальной конторы; †1.01.1854 |
| Афанасий (Соколов) епископ, рукоположен | с 25.06.1841 по 24.12.1853 | архиеп. Иркутский и Нерчинский |
| Парфений (Попов) епископ, рукоположен | с 14.03.1854 по 13.09.1860 | еп. Иркутский и Нерчинский |
| Порфирий (Соколовский) епископ, бывший еп. Уфимский и Мензелинский | с 13.09.1860 по 25.05.1861 | переименован еп. Томский и Семипалатинский |
Томская и Семипалатинская
С 25 мая 1861 года
| Порфирий (Соколовский) епископ, бывший еп. Томский и Енисейский | с 25.05.1861 по 14.11.1864 | на покое; † 3.06.1865 |
| Виталий (Вертоградов) епископ, рукоположен | с 10.01.1865 | † 25.11.1866 |
| Алексий (Новоселов) епископ, рукоположен | с 17.01.1867 по 21.08.1868 | еп. Екатеринославский и Таганрогский |
| Платон (Троепольский) епископ, бывший еп. Екатеринославский и Таганрогский | с 21.08.1868 | †8.10.1876 |
| Петр (Екатериновский) епископ, бывший еп. Уфимский и Мензелинский | с 19.11.1876 по 9.07.1883 | на покое |
| Владимир (Петров) епископ, бывший еп. Бийский, викарий Томской епархии | с 6.08.1883 по 8.03.1886 | еп. Ставропольский и Екатеринодарский |
| Исаакий (Положенский) епископ, бывший еп. Енисейский и Красноярский | с 8.03.1886 по 12.01.1891 | еп. Кишиневский и Хотинский † 11.05.1894 |
| Макарий (Невский) епископ, бывший еп. Бийский, викарий Томской епархии | с 26.05.1891 по 18.02.1895 | переименован еп. Томский и Барнаульский † 16.02.1926 |
Викарии Томской епархии
Бийские епископы
Викариатство учреждено с 1 декабря 1879 года
Кафедра в Бийске
| Владимир (Петров) епископ, рукоположен | с 16.03.1880 по 6.08.1883 | еп. Томский и Семипалатинский; †2.09.1897 |
| Макарий (Невский) епископ, рукоположен | с 12.02.1884 по 26.05.1891 | еп. Томский и Семипалатинский; † 16.02.1926 |
| Владимир (Сеньковский) епископ, рукоположен | с 18.08.1891 по 3.06.1893 | еп. Владикавказский и Моздокский; †1917 |