Свт. Феофан Затворник впервые в русской библеистике составил толкования на послания апостола Павла. Комментарии на первые 13 посланий были завершены при жизни святителя (с 1872 по 1882 годы). В основу толкований положен славянский текст посланий. В некоторых местах святитель обращается к греческому оригиналу, приводя греческие термины. Он старается выявить связь последующего стиха с предыдущим, а также центральную вероучительную идею и ее нравственное приложение.
В «Толковании на послание к Филимону» святитель делит текст на предисловие, основную часть с просьбой о милостивом принятии раба Онисима и послесловие. Он анализирует каждую часть послания, раскрывает побуждения, которыми руководствовался апостол Павел, формулируя свои просьбы. В комментарии показывается духовный смысл описанной ситуации – идею духовного родства христиан вне зависимости от их социального положения.
Также в работе приводятся мнения других святых отцов (свт. Иоанна Златоуста, блж. Феодорита Кирского, блж. Феофилакта Болгарского и др.) о значении послания, обосновывается его включение в канон священных книг и выявляются нравственные уроки текста: необходимость заботы о «малых сих», недопустимость отчаяния в спасении любого человека, уважение к добродетельным рабам и др.