Священник, долго мучившийся от горловой чахотки, помощью отца Иоанна выздоровел, после чего профессор, лечивший батюшку, признал это событие чудесным, так как медицина такого исхода не могла обеспечить. Также успешно Иоанн Кронштадтский исцелял и от брюшного тифа в запущенных формах, когда больных уже готовили к смерти.
Болгарский царь Борис по молитве Кронштадтского излечился от тифа. Всякие болезни поддавались излечению силами молитвы отца Иоанна: многие исцелялись от эпилепсии, воспаления легких.
Одному слепому с рождения крестьянину посчастливилось повидаться с отцом Иоанном на одной из остановок поезда, в котором ехал святой. Обмакнув полотенце в святую воду, Кронштадтский протер глаза слепого — и он вдруг стал видеть. Таким же образом излечил от слепоты отец Иоанн и мальчика, слепого на оба глаза, поврежденные горящими угольками.
Некоторым исцеленным Кронштадтский давал наставления о дальнейшем праведном для них пути. Так одна разбитая параличом женщина была поднята с постели молитвой старца, и ей он наказал ухаживать за тяжело больными. Выздоровевшая женщина после чуда исцеления отправилась в монастырь, где всячески исполняла волю старца.
Молодая и подававшая надежды балерина Императорского балета, случайно получив сильнейшие ожоги, потеряла, как ей казалось, все: и красоту, и возможность получить известность. Сильнейшие ожоги всего тела не оставляли ей шанса даже выжить. Отец Иоанн своей молитвой избавил мучающуюся женщину от ран и уверил ее, что этот случай был на благо. Позднее она убедилась в истинности слов старца: женщина переехала с детьми на окраину города, где счастливо прожила в заботах о детях и муже, исполняя долг праведной жены.
Больную водянкой женщину отец Иоанн взялся исцелить после того, как врачи самых разных специализаций боролись за ее здоровье. Старец дал больной святой воды, а после его отъезда болезнь отступила и женщина прожила еще более 20 лет, никак не ощущая былого заболевания.
Лечил святой Иоанн Кронштадтский и от дефектов речи. Одним лишь наказом говорить чисто он избавил юношу от заикания, которым тот страдал с детства. Успешно молился отец Иоанн за страдающих пьянством. После его помощи люди не испытывали тяги к алкоголю, и жизнь их в корне изменялась.