В миру Михаил Михайлович Грибановский, родился в 1856 году в семье потомственного священника, благочинного городских церквей Елатьмы. Мать — дочь священника. В семье было одиннадцать детей, шестеро из которых умерли в возрасте от одного до двенадцати лет. В детстве и юности Михаил много болел. По воспоминаниям современников, для того, чтобы победить нежелательную сонливость, он ложится спать на сруб колодца; голова — на одной стенке, ноги — на другой. Чтобы выучить не дававшийся ему греческий язык, Михаил, сказавшись больным, на месяц запирается в квартире и затем отлично отвечает в классе.

Рассказ Антона Чехова «Архиерей» (1902) навеян образом епископа Михаила, а описание в рассказе судьбы его матери по смерти Преосвященного, видимо, есть точное описание произошедшего с его родительницей.

Окончил Тамбовское духовное училище, Тамбовскую духовную семинарию, Санкт-Петербургскую духовную академию со степенью кандидата богословия (1884; тема кандидатской работы: «Религиозно-философское мировоззрение философа Гераклита»). Магистр богословия (1888; тема диссертации: «Опыт уяснения основных христианских истин естественной человеческой мыслью. Выпуск 1. Истина бытия Божия.»).

14 января 1884 года пострижен в монашество. 29 января — рукоположен во иеродиакона. С 8 мая — во иеромонаха.

С 15 августа 1884 — и. д. доцента по кафедре основного богословия Санкт-Петербургской духовной академии. С 29 апреля 1887 — и. д. инспектора этой академии.

10 апреля 1888 года возведен в сан архимандрита.

С 1 декабря 1888 — инспектор Санкт-Петербургской духовной академии.

С 27 августа 1890 — настоятель посольской церкви в Афинах (назначен в Грецию после тяжёлого воспаления лёгких, потребовавшего перемены климата).

С 6 августа 1894 — епископ Прилукский, викарий Полтавской епархии.

С 30 ноября 1895 года — епископ Каширский, викарий Тульской епархии.

С 19 января 1897 года — епископ Таврический и Симферопольский.

Епископ Михаил был глубоким знатоком Священного Писания и русской и зарубежной классической литературы (особенно любил произведения Ф. М. Достоевского). Увлекался астрономией. Предметом его научных трудов была философия, в том числе труды Гераклита и Иммануила Канта.

Наиболее известная работа епископа Михаила — «Над Евангелием» — представляет собой сборник эссе на библейские темы, содержащие образные пастырские размышления о смысле жизни, о вере, о «творчестве добра в себе и других».

Будучи архиереем, открывал церковно-приходские школы и вечерние курсы для взрослых, поощрял внебогослужебные собеседования, создавал приходские братства, организовал выпуск журнала «Таврические епархиальные ведомости».

Столь активная деятельность привела к дальнейшему ухудшению состояния здоровья епископа Михаила; он скончался от туберкулёза. По воспоминаниям митрополита Антония (Храповицкого), «он улыбался среди мучительных страданий: задыхаясь, за несколько минут до смерти он шептал друзьям своим свой последний завет о самоотверженном служении Апостольской Церкви».

Был похоронен в левом приделе кафедрального Александровского собора в Симферополе. После разрушения храма в 1930 году был перезахоронен у храма Всех Святых в этом же городе.