То же самое, что сказать: "Зачем ходить в клинику, если врач в душе?"
Бог не в душе, а на Небесах. Он - это не просто некое состояние нашей души и совокупность жизненных принципов и представлений. Бог - это реально существующая Личность, наш Небесный Отец, Который установил истинное учение о спасении человеческих душ, которое несет Православная Церковь Христова. В православных храмах совершаются Таинства, без которых ни полноценное Богообщение, ни, тем более, спасение души просто не возможно. Если следовать Божией воле, заключенной в учении Церкви, то Дух Божий действительно придет в душу человека.
А те, кто считает себя выше Церкви Божией, имеют в своих душах либо просто свои нелепые фантазии вместо Бога, либо, что много хуже, в их душах поселяются иные... "боги".
Подробнее об этом:
http://azbyka.ru/tserkov/o_tserkvi/zachem_tcerkov_bog_v_dushe/index.shtml