Родился в Вологде в семье служащих.
В 1966 году окончил физический факультет Ленинградского государственного университета, где проработал в качестве аспиранта и сотрудника в области научных исследований в физике околоземного космического пространства по 1975 год.
В 1975 году поступил в Ленинградскую Духовную Семинарию.
8 октября того же года в Успенском Крестовом храме митрополичьих покоев митрополитом Ленинградским и Новгородским Никодимом (Ротовым) была совершена хиротесия во чтеца.
С 1978 по 1981 год преподавал логику, основное богословие и догматическое богословие.
8 марта 1979 года архиепископом Выборгским Кириллом (Гундяевым) пострижен в монашество с именем Ианнуарий. 18 марта того же года на 2-й неделе Великого поста им же был рукоположён во иеродиакона, а 22 апреля в Иоанно-Богословском храме Ленинградских духовных академии и семинарии им же рукоположён в сан иеромонаха.
В 1981 году защитил диссертацию на степень кандидата богословия по теме «Святоотеческие толкования так называемых субординационистских мест Священного Писания».
С 1981 года преподавал Новый Завет и Библейское богословие в (Ленинградской) Санкт-Петербургской Духовной Академии.
В 1985 года присвоено ученое звание доцента Ленинградской Духовной Академии.
В 1986 году митрополитом Ленинградским и Новгородским Антонием (Мельниковым) возведён в сан архимандрита.
Являлся членом Синодальной богословской и библейской комиссий, а также комиссии по канонизации святых Русской Православной Церкви, куратор редакции Священного Писания Церковно-научного центра «Православная Энциклопедия», член Российского библейского общества и международного научного общества Colloquium Paulinum. Принимал активное участие в международных конференциях и консультациях. Автор публикаций, а также ряда статей по новозаветной библеистике в Православной энциклопедии. Использовал историко-филологический метод толкования Св. Писания.
Постоянный участник передач радиостанции «Град Петров» (Санкт-Петербург).
С 2005 года — профессор Санкт-Петербургской Православной Духовной Академии.
27 июля 2009 года решением Священного Синода включён в состав Межсоборного присутствия Русской Православной Церкви.
29 января 2010 года президиумом Межсоборного присутствия включён в состав Комиссии по вопросам богословия и Комиссии по вопросам духовного образования и религиозного просвещения.
Преподавал в Санкт-Петербургском государственном университете.
Скончался 21 декабря 2017 года.
Похоронен на Никольском кладбище Александро-Невской лавры.
