Отец с детства воспитывал сына в вере и любви, приучал к благочестию, чтению слова Божия, сердечной молитве. Когда мальчик достиг надлежащего возраста, его определили в Вологодское духовное училище. В 1875 году он продолжил образование в Вологодской семинарии, с 1881 года - в Московской духовной академии. Окончив академию в 1885 году со степенью кандидата богословия, был направлен преподавателем в Харьковскую духовную семинарию.

Преподавательская деятельность

Начало преподавательской деятельности Н. Малиновского совпало с периодом реорганизации духовных семинарий. Изменения коснулись как административной составляющей, так и образовательных программ. Существует мнение, что именно тогда в сознании Николая Платоновича зародилась идея написать труд по Православной догматике.

В 1888 года он принял обязанности законоучителя старших классов реального училища в городе Харькове, и исполнял их до 1892 года. В то же время преподавал Закон Божий в местной женской гимназии.

С 4 февраля 1894 года — инспектор Ставропольской духовной семинарии.

В 1902—1906 годах — ректор Каменец-Подольской духовной семинарии.

В 1904 году удостоен степени магистра богословия за диссертацию «Православное догматическое богословие». В дальнейшем работа была продолжена и дополнена новыми разделами, в результате чего приобрела форму завершенной догматической системы. На протяжении многих лет учебник отца Николая использовался в семинариях в качестве одного из основных учебных пособий.

В 1906—1916 годах — ректор Вологодской духовной семинарии.

В 1916 году, в связи с ослаблением телесного здоровья, подал прошение об отставке.

За плодотворную деятельность был награжден орденами святой Анны III-й и II-й степени.

28 января 1917 года тихо отошел ко Господу.