Различаются значением.
Реформа́торский. Относящийся к реформе, к реформатору. «Мысль об освобождении жизни от излишних опекательств вовсе не новая, она составляет самый явственный и непременный результат реформа́торских попыток последнего времени» (Салтыков-Щедрин).
Реформа́тский и реформацио́нный совпадают в знач. «относящийся к реформации», но различаются употребительностью: реформацио́нный употр. реже. Реформа́тское (реформацио́нное) движение в Германии. Реформа́тские войны.
Реформатский имеет еще значение «протестантский». Реформа́тская церковь.
Розенталь Д. Э. Теленкова М. А. Словарь трудностей русского языка. М.: Айрис-Пресс, 2003. С. 617.