Совпадают в значении «распознать какой-л. предмет, явление и т. п. среди других», но различаются управлением.
Отлича́ть что от чего. Нумизмат отлича́ет настоящие старинные монеты от поддельных.
Различать что и что. Различа́ть добро и зло.
Розенталь Д. Э. Теленкова М. А. Словарь трудностей русского языка. М.: Айрис-Пресс, 2003. С. 449.