Различаются значением.
Про́лог. Древнерусский сборник житий, поучений. «Но Муза Николаевна совершенно не знала, что такое Про́логи» (Писемский А.Ф. Масоны).
Проло́г. Вступление. «Где же тут роман? — печально думал он, — нет его! Из всего этого материала может выйти разве проло́г к роману!» (Гончаров И.А. «Обрыв»).
Розенталь Д. Э. Теленкова М. А. Словарь трудностей русского языка. М.: Айрис-Пресс, 2003. С. 567.