Можно ли канон заменить акафистом?

Епитимию священника, наложенную во время исповеди не может отменить никакой другой священник. Потому надо исполнять её строго по благословению.

Однако, если это только духовный совет, последовавший на Ваш вопрос, то он не имеет такой категоричности. Вы можете исполнять его, можете не исполнять, можете заменить. Однако, если Вы считаете этого батюшку своим духовником и регулярно советуетесь с ним, то лучше задать этот вопрос ему самому. Ведь Вы же, получив совет, взяли на исполнение его благословение. Получится, что Вы не исполнили благословения, взятого при том добровольно. А это уже согрешение. Если же Вы не брали благословения непременно исполнять канон, то вольны поступать, как считаете нужным.

В духовном смысле, что канон, что акафист - равноценны. Однако в дни Великого поста не принято по будням читать акафисты.